Reconstructing glioma progression a generative perspective on gene expression with disentangled VAES

dc.contributor.authorVillamarín, Luis
dc.coverage.campusUNAB Campus Bucaramangaspa
dc.coverage.spatialBucaramanga (Santander, Colombia)spa
dc.date.accessioned2026-01-14T22:03:08Z
dc.date.available2026-01-14T22:03:08Z
dc.date.issued2025-10
dc.description.abstractLos gliomas se encuentran entre los cánceres cerebrales más agresivos, y comprender por qué se vuelven resistentes al tratamiento sigue siendo un gran desafío en neurooncología. Herramientas tradicionales como el Análisis de Expresión Génica Diferencial (DGEA) han ayudado a identificar genes inusualmente activos o inactivos presentes en los tumores. Sin embargo, estos métodos a menudo se basan en modelos lineales simplistas cuando los genes funcionan en redes altamente interconectadas, que a menudo se influyen mutuamente de manera compleja. Esto dificulta distinguir entre las señales causales y los efectos posteriores de la enfermedad. Para superar estas limitaciones, necesitamos herramientas más inteligentes que capturen la estructura no lineal de la expresión génica.spa
dc.description.abstractenglishGliomas are among the most aggressive brain cancers, and understanding why they become resistant to treatment remains a big challenge in neuro-oncology. Traditional tools like Differential Gene Expression Analysis (DGEA) have helped identify unusually active or inactive genes that are present in tumors. However, these methods often rely on simplistic, linear models when genes function in highly interconnected networks, often influencing each other in complex ways. This makes it hard to distinguish between causal signals and downstream effects of the disease. To go beyond these limitations, we require smarter tools to capture nonlinear structure of gene expression.spa
dc.description.learningmodalityModalidad Presencialspa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.instnameinstname:Universidad Autónoma de Bucaramanga - UNABspa
dc.identifier.issn3073-0953
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional UNABspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repository.unab.edu.cospa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12749/32577
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad Ciencias de la Saludspa
dc.publisher.facultyFacultad Ingenieríaspa
dc.publisher.grantorUniversidad Autónoma de Bucaramanga UNABspa
dc.publisher.programPregrado Ingeniería Biomédicaspa
dc.relation.referencesReconstruction of the first 30 gene expression values for a glioma patient with original PFS status 0. After enforcing status 1 using the D-VAE, important changes appear around gene 6 highlighting the progression-related shifts.spa
dc.relation.referencesStructure of D-VAE model with disentangled latent featuresspa
dc.relation.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12749/32166spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia*
dc.rights.localAbierto (Texto Completo)spa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/*
dc.sourceBRAIN : Biomedical and bioengeneering Research and Innovation Network. No. 01. Páginas 09-11eng
dc.subject.keywordsIntracranial tumorsspa
dc.subject.keywordsGenetic expressionspa
dc.subject.keywordsHuman geneticsspa
dc.subject.lembGenesspa
dc.subject.lembCáncerspa
dc.subject.lembTumores intracranealesspa
dc.subject.lembGenética humanaspa
dc.subject.proposalExpresión genéticaspa
dc.titleReconstructing glioma progression a generative perspective on gene expression with disentangled VAESspa
dc.title.translatedReconstructing glioma progression a generative perspective on gene expression with dissentangled VAESspa
dc.typeArticleeng
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/articlespa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
dc.type.localArtículospa
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTDIV

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